Loading… 迄今最完整精确版本!脊椎动物基因测序获重大成果,有望解码7万物种生命奥秘 _TOM健康
正文
Qzone
微博
微信

迄今最完整精确版本!脊椎动物基因测序获重大成果,有望解码7万物种生命奥秘

2021-05-10 19:42 前瞻网   

 

脊椎动物基因组项目(VGP)近日在《自然》杂志上发表了数十名合著者的论文,称通过一种新的DNA测序技术和组装方法,研究团队获得了脊椎动物基因组项目(VGP)的首个主要成果:25个物种的高质量基因组。

这项研究包括了16个二倍体高质量的、近乎无错误的、近乎完整的脊椎动物参考基因组集合,涵盖了所有具有脊椎的类群(即哺乳动物、两栖动物、鸟类、爬行动物和鱼类),从VGP项目第一阶段的5年试点工作开始。

迄今最完整精确版本!脊椎动物基因测序获重大成果,有望解码7万物种生命奥秘

在《自然》杂志的一期特刊上,与其他科学期刊同时发表的论文中,VGP详细介绍了基于这16个基因组组合的众多技术改进。在这项旗舰研究中,VGP展示了设置和实现高质量参考基因组质量指标的可行性,使用了他们最先进的自动化方法,将长读和长程染色体支架方法与将基因组组装拼图碎片放在一起的新算法相结合。

VGP正在利用过去几年测序技术的巨大进步,开始为所有7万种活的脊椎动物生产高质量的参考基因组集合。到目前为止,目前的VGP图谱已经提交了129个二倍体组合,代表了迄今为止这些物种最完整和准确的版本,未来将产生数千个基因组组合。

自2016年启动以来,VGP纳入了包括来自12个不同国家50多个机构的数百名国际科学家。这是生物学科历史上最大胆的科研项目之一,幸运的是——新的基因测序技术缩短了读取基因数据的时间,降低了测序成本,也提升了基因组组装结构的质量。

在这篇论文揭示的16个基因组中,以及在第一波论文的20多篇论文中,共有25个基因组中的其他新的生物学发现,包括:

错误基因或染色体丢失的纠正,以前的装配遗漏了30%-50%的富含gc蛋白编码的基因调节区域,这些区域被认为属于基因组的“暗物质”;

新发现的斑胸草雀和鸭嘴兽染色体;

大多数物种的线粒体基因组是完全和无错误的,有些是在不需要组装的单分子序列中产生的;

单孔目哺乳动物和鸟类的野生性染色体进化;

人类和狨猴之间的基因变异对狨猴作为一种新兴的非人类灵长类动物生物医学研究模型系统有影响;

谱系特异性变化塑造了鸟类和哺乳动物基因组的进化:鸭子、鸸鹋、鸭嘴兽和针鼹;

对催产素和缩宫素配体和受体家族普遍的基于进化的修订命名的建议;

……

下一步,VGP将继续合作在全球范围内与其他财团完成项目的第一阶段——将测序物种扩大到260个,覆盖所有脊椎动物基因组,并力争在10年内解码所有真核生物的基因组。

第二阶段将重点研究各脊椎动物科的代表性物种,目前正在进行样本鉴定和募集工作。

译/前瞻经济学人APP资讯组

本文来源前瞻网,转载请注明来源。本文内容仅代表作者个人观点,本站只提供参考并不构成任何投资及应用建议。(若存在内容、版权或其它问题,请联系:service@qianzhan.com)

 

责任编辑: 3976DBC

责任编辑: 3976DBC
相关推荐

基因中隐藏着一个“寿命时钟” 能准确预测脊椎动物的最大寿命

脊椎动物是如何进化而来的?西北工业大学王文联合多机构发布非洲肺鱼基因组研究

宠物基因检测公司「宠耀基因」获百万天使轮融资,由嘉远资本投资

行业一周丨B2B/企业服务动态盘点(04.22-04.28) IBM陈黎明:全球企业都在焦虑行业发展中公司的自我定位与发展,其中包括创新的焦虑与数据挖掘的焦虑,IBM总结了三个“P”:第一,企业要有自己的平台战略,一方面要搭建自己的平台;另一方面,也要利用好别人的平台;第二,未来的流程应该把人工智能嵌入到日常的工作流程当中去,这个流程包括了流程的各个方面,不仅是生产过程本身;第三,利用人工智能技术,IBM在人力资源层面取得巨大进展,使得IBM每年成本节约达到1000万美元。 嘉御基金卫哲:当你忘记掉速来,当你不再仅仅享受人口红利,当广度不成为你创始一个公司的绝对必要条件的时候,深度变得很重要。能成功就需要做成四个字“广深高速”,广度、深度、高度、速度。 金沙江创投朱啸虎:①从PC互联网到移动互联网,现在正进入微信互联网时代。因为微信有9.86亿用户,并保持极高的打开频次。相信微信互联网会比移动互联网进化的快,可能2年时间就会形成稳固格局。②APP的流量红利和创业优势不在。“今天创业一定要先做小程序,如果小程序没有用户粘性,那也不用做APP了。”③小程序酝酿巨大的投资机会,2017年小程序融资额是7亿,今年应该能达到100亿元。④小程序赛道看好社交电商、O2O、内容付费、小游戏等几条赛道。

15分钟!阿里云又创纪录 助华大基因一顿饭功夫完成基因测序