RNA生物学的新突破：可同时对多个RNA碱基修饰进行测序

基因转录成RNA后，组成RNA分子的亚单位或“碱基”可能会发生修改，从而会影响其结构和功能。对这些变化的研究被称为“表观转录组学”（epitranscriptomics），也称为“RNA表观遗传学”。这些碱基修饰可以发生在大多数类型的RNA分子上，包括微RNA（microRNA）。

微RNA是小型非编码RNA分子，通过干扰和抑制一个基因的表达而发挥调节作用。微RNA的碱基修饰可以影响它们的处理方式以及抑制目标的效率，改变它们的功能。因此，这些修饰对了解RNA的功能很重要，但以往很难对其进行检测。

近日，日本大阪大学的一个研究小组已经对一种微RNA进行了测序，它是“难以医治”胃肠癌的一个标志，对治疗没有反应。研究人员能够使用一个单分子量子测序仪，同时直接检测两种类型的化学碱基修饰。

大阪大学研究团队从结直肠癌细胞中分离出微RNA，并对单个RNA分子进行测序。量子测序仪使用电来区分基于其独特电导率值的碱基，电导率值衡量分子传导电流的能力。由于化学修饰会改变碱基的电导率，这种方法有可能被用来识别任何种类的核苷酸修饰。研究中，研究人员专注于两种常见的修饰，m6A和5mC，分别向腺苷（A）核苷酸和胞苷（C）核苷酸添加一个甲基。

使用单分子量子测序仪，研究团队观察到的修饰比率，与使用其他方法计算的比率相当。通过观察，结果表明，这两种类型的修饰能够相互影响。m6A修饰的存在似乎有助于5mC修饰。5mC甲基化的速度一般受甲基化和去甲基化酶的活动影响，因此结果意味着这些酶的活动能够被m6A修饰所促进或停用。

研究人员表示，这项工作为测序各种类型的RNA碱基修饰提供了一个强大的新工具，这种方法可用于全面分析和检测表观转录组中的甲基化位点。这将使人们更多地了解这些甲基化事件及其机制，改变RNA生物学的面貌，迎来一个新的时代。

题为“Single-molecule RNA sequencing for simultaneous detection of m6A and 5mC”的相关研究论文发表在《科学报告》（Scientific Reports）上。

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